Конформация пептидных связей характеризуется особенностями (Полинг с сотр., США 1939г.),
· связь С–N короче, чем другие ординарные связи (0,132 нм против 0,147 нм) за счет мезомерного сопряжения (+М-эффект) группы NH и (–М-эффект) группы С=О;
· имеет характер частично двойной связи, а значит, вращение вокруг нее заторможено (жесткая плоская структура);
· связь С=О удлиняется до 0,124 нм против обычной длины 0,121 нм;
· кислород карбонильной группы и водород –NH- группы находятся в транс-положении по отношению друг к другу.
· Каждая третья связь, зафиксированная в плоскости пептидной группы, является жесткой, и нет свободного вращения.
· Группы R - чередуются по обе стороны пептидной связи, т. е. есть транс-изомерия.
0,124 нм боковой радикал α-углеродный атом
α-С атом Боковой 0,132 нм 0,147 нм