Трансферазы
Оксидоредуктазы
Классификация и номенклатура ферментов.
Номенклатура – названия индивидуальных соединений, их групп, классов, а также правила составления этих названий. Номенклатура ферментов бывает тривиальной (короткое рабочее название) и систематической. По систематической номенклатуре, принята в 1961г Международным союзом биохимии, можно точно идентифицировать фермент и его катализируемую реакцию.
Классификация – разделение чего либо по выбранным признакам.
1. Классификация ферментов осуществляется по типу катализируемой реакции и ее механизму;
2. Реакции и ферменты, которые их катализируют, подразделяют на 6 классов, в каждом из которых несколько подклассов (4-13);
3. Название фермента состоит из 2 частей. 1 часть – название субстрата (субстратов). 2 часть – тип катализируемой реакции. Окончание – АЗА;
4. Дополнительная информация, если необходима, пишется в конце и заключается в скобки: L-малат + НАД+ ↔ ПВК + СО2 + НАДН2 L-малат: НАД+ - оксидоредуктаза (декарбоксилирующая);
5. По классификации ферментов каждый фермент имеет свой шифр КФ 1.1.1.1. Первая цифра обозначает класс, вторая - подкласс, третья - подподкласс, четвертая - порядковый номер фермента в его подподклассе.
В правилах названия ферментов нет единого подхода.
Окислительно-восстановительные реакции. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются, одно окисляется, другое восстанавливается: Sвост + S’окисл ↔ S’вост + Sокисл
Систематическое название включает в себя название донора е и Н+ через двоеточие название акцептора через тире – название класса: донор: акцептор ( косубстрат) оксидоредуктаза
R-CH2-OH + НАД+ ↔ R-CH=О + НАДН2
Алкоголь: НАД+ оксидоредуктаза [алкогольдегидрогеназа]. КФ 1.1.1.1
Ферменты этого класса принимают участие в переносе атомных групп, молекулярных остатков от одного соединения к другому. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются: S-G + S’ ↔ S + S’-G. В зависимости от переносимых групп различают: 1). фосфотрансферазы; 2). аминотрансферазы; 3). гликозилтрансферазы; 4). метилтрансферазы; 5). ацилтрансферазы.
Систематическое название откуда: куда в какое положение–что–трансфераза
или донор: акцептор–транспортируемая группа– трансфераза
АТФ + D-гексоза ↔ АДФ + D- гексоза-6ф
АТФ: D-гексоза-6-фосфотрансфераза
3. Гидролазы.Расщепляют ковалентную связь с присоединением молекулы воды.
В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются: S-G + Н2О ↔ S-ОН + G-Н.
В зависимости от характера субстрата, различают подклассы: 1). гликозидазы – гидролиз гликозидов (лактоза – лактаза, мальтоза – мальтаза, сахароза – сахараза); 2). пептидазы – гидролиз пептидных связей; 3). эстеразы – разрыв связи в сложных эфирах.
Систематическое название субстрат–что отщепляется–гидролаза
или субстрат–гидролаза
Ацетилхолин + Н2О ↔ Ацетат + Холин
Ацетилхолин-ацилгидролаза, Ацетилхолин-гидролаза