Задачі для самостійного розв’язання

1. EcoRI вносить один розрив в молекулу ДНК. Скільки утвориться фрагментів, якщо це: 1) лінійна молекула; 2) кільцева молекула.

2. Скільки утвориться фрагментів під дією трьох рестриктаз, які вносять по одному розриву в: 1) лінійну молекулу; 2) кільцеву молекулу. Вкажіть можливі варіанти.

3. Яка з двох рестриктаз, MboI чи MstI, внесе більше розривів в ДНК, яка є випадковою послідовністю нуклеотидів?

4. Яка з двох рестриктаз, AccI чи HpaII, внесе більше розривів в ДНК, яка є випадковою послідовністю нуклеотидів? Поясніть.

5. “Липкий кінець”, утворений рестриктазою BamHI, зливається з “липким кінцем”, утвореним рестриктазою XhoII . Сайт впізнавання якої рестриктази залишиться (утвориться) в результаті реакції?

6. “Липкий кінець”, утворений рестриктазою XhoI, зливається з “липким кінцем”, утвореним рестриктазою AvaI . Сайт впізнавання якої рестриктази залишиться (утвориться) в результаті реакції?

7. Задайте послідовність нуклеотидів, яка була би полілінкером для таких рестриктаз:

AvaI ; BamHI ; HpaII .

8. Задайте послідовність нуклеотидів, яка була би полілінкером для таких рестриктаз:

HaeIII ; HindIII ; HindII .

9. Використовуючи задану послідовність нуклеотидів, створіть сайт впізнавання для таких рестриктаз:

CCGG HpaII, XmaI, AvaI, NaeI.

Покажіть направлення розщеплення. Яка з рестриктаз впізнає декілька

послідовностей і які саме?

10. Використовуючи задану послідовність нуклеотидів, створіть сайт рестрикції для таких рестриктаз:

TCGA TogI, ClaII, PvuI.

Покажіть направлення розщеплення. Яка з рестриктаз впізнає декілька

послідовностей і які саме?

11. Які фрагменти утворяться при гідролізі молекули ДНК довжиною 900 п.н. рестриктазою, якщо вона вносить один розрив на 150 п.н. Вкажіть можливі варіанти.

12. При обробці кільцевої молекули ДНК віруса SV40 окремими рестриктазами та їх сумішшю одержують такі фрагменти (розміри в т.п.н.):

EcoRI – 5,2; HindII – 2,4; 2,3; 0,5; HindIIІ – 3,2; 2,0; EcoRI і HindII – 2,3; 1,3; 1,1; 0,5; EcoRI і HindIII – 3,2; 1,3; 0,7; HindII і HindIII – 2,1; 1,8; 0,6; 0,5; 0,2.