CGTCG(N)12

BinI GGATC(N)4

CCTAG(N)5

FokI GCATG(N)9

CCTAC(N)13

HgaI GACG(N)5

CTGCG(N)10

HpbI GGTG(N)8

CCACT(N)7

MboII GAAGA(N)8

CTTCT(N)7

MnlI CCTC(N)7

GGAG(N)7

SfaNI GCATC(N)5

CGTAG(N)9

Tth111I CAAACA(N)11

GTTTGT(N)9

* Наведені послідовності двох ланцюжків ДНК, причому верхня відповідає 5′ → 3′-напрямку.

 

Приклади задач

 

1. Яка з двох рестриктаз, BamHI чи HaeIII , внесе більше розривів в молекулу ДНК, що являє собою випадкову послідовність нуклеотидів? Поясніть.

 

Розв’язання.

Рестриктаза BamHI впізнає гексануклеотидну послідовність, а рестриктаза HaeIII впізнає тетрануклеотидну послідовність. Сайт для рестрикції HaeIII зустрічається приблизно через кожні 256 п.н. (4⁴), а сайт рестрикції для BamHI через кожні 4069 п.н. (4⁶). Безумовно в ДНК, яка є випадковою послідовністю нуклеотидів рестриктаза HaeIII зробить більше розривів.

 

2. “Липкий кінець”, утворений рестриктазою BamHI , зшивають з “липким кінцем”, утвореним рестриктазою BglII . Який сайт рестрикції залишиться (утвориться) при зшиванні?