N — численность популяции или выборки

Приложение 2

Значения t при различных уровнях значимости Р

Приложение 3

 

Значения F при уровне значимости 0,05 (df — число степеней свободы для большей дисперсии,

Которая находится в числителе)

Продолжение приложения 3

Приложение 4

 

Значения F при уровне значимости 0,01 (df — число степеней свободы для большей дисперсии,

Которая находится в числителе)

Продолжение приложения 4

Приложение 5

c² распределение

БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

 

К главам 1-3:

Айала Ф. Введение в популяционную и эволюционную генетику. — М.: Мир, 1984, 256 с.

Кайданов Л. 3. Генетика популяций — М.: Высшая школа, 1996, 277 с.

Ли Ч. Введение в популяционную генетику. — М.: Мир, 1978, 556 с.

Bos I., Caligari P. Selection methods in plant breeding. — London, Chapman & Hall Ltd, 1995. 238 p.

 

К главам 4-14:

1. Федин М.А., Силис Д.Я., Смиряев А.В. Статистические методы генетического анализа. — М.: Колос, 1980, 210 с.

2. Седловский А.И., Мартынов С.П., Мамонов Л. К. Генетико- статистические подходы к теории селекции самоопыляющихся культур. — Алма-Ата: Наука, 1982, 198 с.

3 Мазер К., Джинкс Дж. Биометрическая генетика.— М.: Мир, 1985, 465 с.

4. Смиряев А.В., Мартынов С.П., Кильчевский А.В. Биометрия в генетике и селекции растений. М.: Издательство МСХА, 1992, 268 с.

5. Турбин Н.В., Хотылева Л.Н., Тарутина Л.А. Диаллельный анализ в селекции растений. — Минск: Наука и техника, 1974, 185 с.

6. Драгавцев В.А., Цильке Р.А., Рейтер Б.Г. и др. Генетика признаков продуктивности яровой пшеницы в Западной Сибири. — Новосибирск: Наука, 1984, 230 с.

7. Савченко В. К. Генетический анализ в сетевых пробных скрещиваниях. — Минск: Наука и техника, 1984, 225 с.

8. Рокицкий П.Ф. Введение в статистическую генетику. — Минск, Вышейшая школа, 1978, 442 с.

9. Смиряев А.В., Гохман М.В. Биометрические методы в селекции растений. — М.: Агропромиздат, 1985, 215 с.

10. Wricke G., Weber W. Quantitative genetics and selection in plant breeding. — Berlin — New York, 1986, 380 p.

11. Кильчевский А.В., Хотылева Л.В. Экологическая селекция растений. — Минск: Тэхналогiя, 1997, 372 с.

12. Жученко А.А. Экологическая генетика культурных растений: Адаптация, рекомбиногенез, агробиоценоз. — Кишинев, 1980, 590 с.

ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ

 

Аддитивная схема (модель) наследования

Аддитивно-доминантная схема наследования

Аллоконкуренция

Анализ

— биометрико-генетический

— генетический

— генетической полиморфности популяции

— диаллельный

— дисперсионный

— многофакторный

— кластерный

— ковариационный

— компонентный

— популяционно-генетический

— регрессионный

— факторный

Ассоциат

Ассоциативная способность

— подвоя

— привоя

Аутоконкуренция

Банки данных

Биометрия

Биометрическая генетика

Блоки коадаптированных генов

Векторный метод

Вес признака (экономический)

Взаимодействие

— генотип-среда

— подвоя и привоя

— подвой-привой

— эпистатическое

 

— типа «гомозигота-гомозигота»

— типа «гомозигота-гетерозигота»

— типа «гетерозигота-гетерозигота»

Выборочная доля признака

Гена (ов)

— дрейф (генетический дрейф)

— мутации

— сцепление (рекомбинация)

— частота

Генетический груз

Генотип (а)

— агрессивность

— адаптивный

— приспособленность

Гипотезы эволюции (классическая и балансовая)

Дендрограмма

Дивергентность родителей

Дисперсия

— аддитивная (аддитивных эффектов генов)

— взаимодействия генотип-среда

— генетическая

— генотипическая

— доминантная (доминантных эффектов генов)

— селекционной ценности генотипов

— средовая (паратипическая)

— фенотипическая

— эпистатических эффектов

Доверительный интервал для доли

Закон Харди-Вайнберга

Идеал потомства (идеотип, идеальный сорт)

Инбридинг (а)

— влияние на структуру популяции

— коэффициент

Индекс

— селекционный

— условий среды

— фенотипический

— фоновый

Индикатор условий испытания

Интеграл

— вероятности трансгрессивных линий

Кластер

Ковариация

— фенотипическая

генотипическая

Комбинационная способность

— изменчивость

— общая

— специфическая

Комплементационное отношение

Комплементация генотипов

Компьютерный сервис

Конкурентная способность (конкурентоспособность) генотипа

— общая

— специфическая

Корреляция

— генотипическая

— средовая (паратипическая)

— фенотипическая

— экологическая

Корреляционные плеяды

Коэффициент

— ассоциативной способности

— подвоя

— привоя

— варьирования качественного признака

— взаимной сопряженности качественных признаков

— инбридинга

— корреляции

— внутрикластерный

— ранговый

— средовой (паратипический)

— фенотипический

— наследуемости

— в узком смысле

— в широком смысле

— повторяемости

— предсказуемости среды

— регрессии

— родства

— типичности среды

Кривая

— нормального распределения

— оптимума

— роста

— Сакса

Критерий хи-квадрат

Локусы

— количественных признаков (QTL)

— полиморфные

Макроусловия выращивания

Матрица

— ковариационная

— коэффициентов корреляции (корреляционная)

— скрещиваний

Мера

— расстояния

— сходства

Метод (ы)

— биометрические

— биометрико-генетические

— главных компонент

— Гриффинга

— вариант I (модель I)

— вариант II (модель II)

— двухкомпонентный

— многомерные статистические

— наименьших квадратов

— педигри

— регрессии на средние

— селекционных индексов

— скользящей средней

— фоновых признаков

— Хеймана

— параметрический

— регрессионный

Миграция

— влияние на структуру популяции

«Минус»-аллель

Модель(и)

— биометрическая

— биометрико-генетическая

— идеального сорта

— имитационная

— конкуренции генотипов

— математическая

— олигогенная

— полигенная

— регрессии на средние

— роста в онтогенезе

— системы генотипов

— феноменологическая

— эколого-генетического контроля количественных признаков

Моделирование

— имитационное

— математическое

Модуль признака

Наследование

— олигогенное

— полигенное

Нейтральной эволюции теория (концепция)

Нормированное отклонение

Отбор (а)

— естественный

— интенсивность

— искусственный

— коэффициент

— рекуррентный

— семейный

— полусибсов

— полных сибсов

— эффективность

Ошибка выборочной доли

Пакет прикладных программ

Паспортные данные культуры (банки паспортных данных)

Переопределение генетической формулы признака

Периодичность плодоношения

«Плюс»-аллель

Повторяемость

— возрастная

— параметров среды

— паратипическая

Показатель (и)

— генетической дивергенции форм (популяций)

— неравновесия по сцеплению

— ожидаемой гетерозиготности популяции

— относительной приспособленности генотипа

— полиморфности популяции

— приспособленности генотипа (степень)

— средней гетерозиготности популяции

— средней приспособленности популяции

Полимерия

Полиморфизм сбалансированный

Популяция

— замкнутая

— панмиктическая

— равновесная

— раздельнополая

Популяции

— гомозиготизация

— подразделенность

— равновесие

- генетическое

- генотипическое

— структура

- генетическая

- генотипическая

— эволюция

— эффективная численность

Популяционная генетика

Признак

— качественный

— дисперсионный анализ изменчивости

— однофакторный

— двухфакторный

— показатель изменчивости

— сопряженность

— количественный

— селекционный

— фоновый

Продуктивность среды

Равновесие популяции

— нетривиальное

Расстояние

— евклидово

— Махаланобиса

Робастность

Селекционный дифференциал

Скрещивание

— ассортативное

— дизассортативное

— насыщающее

Скрещивания схема

— бипарентальная

— диаллельная

— неполная

— полная

— поликросс

— сетпрос

— топкросс

— триаллельная

— трипарентальная

— трифакториальная

— тройной тест-кросс

— факториальная

Совокупность сред

— целевая

Среда(ы)

— дифференцирующая

— дифференцирующая способность

— относительная

— предсказующая способность

— типичность

— Стабильность признака

Степень

— доминирования

— интенсивности периодичности плодоношения

— периодичности плодоношения

Стержневая (core) коллекция

Теорема Фишера

Типичность среды

Толерантности закон

Фиксация аллеля

Фон (среда)

— анализирующий (дифференцирующий)

— нивелирующий

Функция

— Гомпертца

— качества

— логистическая (роста)

Ценность

— генотипическая

— популяции

— селекционная

— фенотипическая

Частота

— аллеля

— генотипа

— рекомбинации

— фенотипическая

Эковаленты

Экологическая ниша (экониша)

— Эксперимент модельный (имитационный)

Эпистатическое взаимодействие генов

Эффект (ы)

— взаимодействия

— генотип-среда

— подвоя и привоя

— генов

— аддитивный

— доминантный

— эпистатический

— генотипа

— замещения аллеля

— комбинационной способности

— общей

— специфической

— маскирующий

— отбора

—плейотропный

— подвоя

— привоя

— реципрокный

—среды (средовой)

УКАЗАТЕЛЬ ОБОЗНАЧЕНИЙ

 

a_i — экономический вес i-го признака в селекционном индексе

a_i — аддитивный эффект гена

|а| — суммарный аддитивный эффект

В — степень периодичности плодоношения

B₁ — беккросс на первого родителя

B₂ — беккросс на второго родителя

b_y/x — коэффициент регрессии признака у на признак х

b_i — коэффициент i-го признаке в селекционном индексе

cov_kl — ковариация между k-м и l-м признаками

cov_e — средовая ковариация

cov_g — генотипическая ковариация

cov_p — фенотипическая ковариация

CD_ij — коэффициент дивергенции i-го и j-го генотипов

d_i — доминантный эффект гена

|d| — суммарный эффект доминирования

DG — ожидаемый ответ на индексный отбор

Dq — эффективность отбора против аллеля с частотой q

D — показатель неравновесия по сцеплению

D — генетическое расстояние по Нею

D — дисперсия аддитивных эффектов (аддитивная дисперсия)

D_ij — расстояние Махаланобиса между i-м и j-м генотипами

D_j — допустимое отклонение j-го признака от идеала

d_ij — эвклидово расстояние между i-м и j-м генотипами (параметр дивергенции объектов)

df — число степеней свободы

e — индекс, обозначающий равновесие популяции

e — случайная ошибка опыта

е_k — случайная ошибка наблюдения в k-ом повторении опыта

e_ijk — ошибка наблюдения i-го варианта в j-й среде в k-м повторении

E_j — эффект j-й среды

F — коэффициент инбридинга

F — отношение средних квадратов в дисперсионном анализе (F-критерий)

— средняя j-го признака у потомства

F_n — n-е поколение потомства после гибридизации

F_¥ — популяция гомозиготных линий после расщепления гетерозигот

FQ — функция качества в двухкомпонентном методе

f(x), f(y)— плотности распределения признака х(у)

f_i — частота i-гo генотипа в популяции

G — генотипический критерий в методе селекционных индексов

G_i — генетическая ценность i-гo генотипа

G×E — взаимодействие генотип-среда

g— частота гаметы, содержащей более одного аллеля

g_i, g_j — эффекты общей комбинационной способности i-го (j-го) родителя

g_i или G_i — генотипическая ценность (эффект) i-гo генотипа

НСР — наименьшая существенная разность

Н, H₁, H₂ — дисперсия эффектов доминирования

H² — коэффициент наследуемости в широком смысле

— средняя гетерозиготность популяции

— ожидаемая средняя гетерозиготность популяции самоопылителей

h² — коэффициент наследуемости в узком смысле

I_i — величина селекционного или фонового индекса i-й линии

I_j — значение j-го признака у идеала

i — эффект взаимодействия типа «гомозигота-гомозигота»

j — эффект взаимодействия типа «гетерозигота-гомозигота»

K— степень перекрестного опыления в популяции

k — степень предпочтительного оплодотворения в популяции

|I| — суммарный эпистатический эффект

I — степень интенсивности периодичности плодоношения

K — коэффициент взаимной сопряженности качественных признаков (коэффициент Чупрова)

k — стандартный селекционный дифференциал

K_ij — комплементационное отношение

L_1i — семья, полученная от скрещивания i-гo растения F₂ с Р₁

L_2i — семья, полученная от скрещивания i-го растения F₂ с Р₂

L_3i — семья, полученная от скрещивания i-го растения F₂ с F_l

l — взаимодействия типа «гетерозигота-гетерозигота»

т или М или m— среднее значение признака в популяции (в наборе генотипов)

m_ij — скользящая средняя для i-й делянки в j-м ярусе

max — максимальное значение

МР — среднее произведение

N — численность популяции или выборки

N_e — эффективная численность популяции

Р — фенотипическое значение признака

Р — вероятность

Р — показатель средней гетерозиготности популяции

P₁ — первый родитель

Р₂ — второй родитель

P_j — коэффициент предсказуемости j-й среды

р, q — частоты двух аллелей полиморфного локуса

р_i — частота i–го аллеля

r_ij — реципрокный эффект при скрещивании i-го и j-го родителя

R_ij — коэффициент родства

r_е — средовой коэффициент корреляции

r_g — генотипический коэффициент корреляции

r_р — фенотипический коэффициент корреляции

r_w — коэффициент ранговой корреляции Спирмена

S — селекционный дифференциал

s_i — коэффициент отбора i-го генотипа

s_p — ошибка выборочной доли

SP — сумма произведений

s_ij — эффект специфической комбинационной способности

S_ij — мера сходства между i-м и j-м генотипами

— относительная дифференцирующая способность j-й среды

Sim_ij — мера сходства, основанная на генетических маркерах

S — показатель изменчивости качественного признака

t — t-критерий Стьюдента

t_j — коэффициент типичности среды

var(ĝ_i) — дисперсия ошибки оценки ĝ_i

var(ĝ_i-ĝ_j) — дисперсия ошибки разности ĝ_i и ĝ_j

Vp — коэффициент фенотипической вариации

Vp — дисперсия величины признака у родителей в диаллельной таблице

V_ij или (G×E)— взаимодействие генотип-среда

V_r — дисперсия признака для членов одной строки (столбца) диаллельной таблицы

W_i — приспособленность генотипа

W_r — ковариация признака у родителей и потомков для членов одной строки (столбца) диаллельной таблицы

— средняя приспособленность популяции

w_i — относительная приспособленность i-го генотипа

w_i — эковаленты (по Врике)

— средняя k-го признака

X… — сумма по всему опыту (результат суммирования по i, j, и k)

X.. — сумма по i и j

X_i. — i-я сумма по j

X._j — сумма по j-му блоку

X_ij. — сумма по делянке i-гo варианта в j-м блоке

у' — преобразованное или скорректированное наблюдение

y_ijk — значение признака у i-го формообразца (варианта) в j-й среде в k-м повторении (блоке)

y_i. — средняя i-го варианта по п повторениям

y_i.. — средняя i-го сортообразца (варианта) по тсредам и п повторениям

z_ik — нормированное наблюдение k-го признака у i-го объекта

D — заданная точность (при планировании объема выборки

∆q — сдвиг частоты гена

e — оператор выделения целой части числа

λ — показатель снижения доли гетерозигот за одно поколение с инбридингом

m или М — среднее значение признака в популяции

П — доля родителя в геноме потомка

П — оператор произведения

r — коэффициент корреляции в генеральной совокупности

s² — дисперсия

s — стандартное отклонение

s_k — стандартное отклонение по k-му признаку

, — средовая дисперсия и дисперсия ошибки полевого опыта (серии опытов)

— генотипическая дисперсия

— фенотипическая дисперсия

— дисперсия доминантных эффектов генов

— дисперсия ассоциативной способности i-го (привоя)

— дисперсия дифференцирующей способности j-й среды

— дисперсия ошибки

— дисперсия взаимодействия генотип-среда

S — оператор суммирования

c² — критерий хи-квадрат

ОГЛАВЛЕНИЕ

 

Введение………………………………………………………………….3

 

Глава 1. Популяционно-генетический анализ…………………………....7

 

1.1. Общие сведения…………………………………………………………7

1.2. Анализ структуры панмиктической популяции………………………9

Контрольные вопросы и задания…………………………………….24

 

Глава 2 Факторы изменения структуры популяции……………….26

 

2.1. Различные схемы скрещивания………………….…………………26

2.2. Случайные колебания частоты генов (генетический дрейф) …….41

2.3. Отбор по качественным признакам………………………………………...49

2.4. Естественный отбор…………………………………………………..54

2.5. Мутации генов………………………………………………………..64

2.6. Подразделенность и миграция……………………………………….68

Контрольные вопросы и задания…………………………………..72

 

Глава 3. Анализ генетического разнообразия популяции……….75

 

3.1. Генетическая полиморфность............................................................75

3.2. Оценки генетической дивергенции………………….…….…………80

Контрольные вопросы и задания…………………………….…….88

 

Глава 4. Биометрико-генетические модели изменчивости признаков……………………………………………………………………89

 

4.1. Количественные и качественные признаки……………….……89

4.2. Эффекты гена, генотипа, среды и их взаимодействий.…………93

4.3. Основные статистические методы биометрической генетики.100

Контрольные вопросы и задания…………………………………….104

 

Глава 5. Генотипическая ценность популяции……………..…….105

 

5.1. Общие сведения……………………………………………………….105

5.2. Модели скрещиваний………………………………………………….106

5.3. Синтетические сорта и двойные гибриды………………………110

5.4. Биометрический анализ инбридинга и гетерозиса……………….114

5.5. Тестирование селекционной ценности…………………………….120

Контрольные вопросы и задания…………………………………..125

 

Глава 6. Компоненты дисперсий и отбор по количественному признаку………………………………………………………………….127

 

6.1. Цель разложения дисперсий………………………………….……127

6.2. Оценка наследуемости………………………………………………129

6.3. Структура изменчивости признака для самоопылителей……….138

6.4. Перекрестноопыляющиеся культуры…………………………..……144

Контрольные вопросы и задания…………………………………..153

 

Глава 7. Планирование скрещиваний………………………………155

 

7.1. Основные сведения о методах подбора родителей……….………155

7.2. Близость к идеальным значениям по комплексу признаков ……...157

7.3. Оценка генетической дивергентности родителей ………………….165

7.4. Оценка сходства родительских форм по генетическим данным…171

7.5. Варианты использования показателей дивергенции………………175

7.6. Прогноз вероятности трансгрессий ………..………………………...178

Контрольные вопросы и задания…………………………………183

 

Глава 8. Диаллельный анализ………………………………….….185

 

8.1. Схемы скрещивания для анализа методами Гриффинга

и Хеймана……………………………………………………………....185

8.2. Общая и специфическая комбинационные способности………187

8.3. Анализ диаллельных таблиц по Хейману………………..…….202

8.4. Модифицированные схемы диаллельных скрещиваний………..219

Контрольные вопросы и задания…………………………………225

 

Глава 9. Биометрико-генетические методы отбора……..…….227

 

9.1.Маскирующие эффекты при отборе…………………….…………227

9.2. Снижение эффектов пестроты почвенного плодородия…………229

9.3. Фенотипическая, генотипическая, генетическая и средовая

корреляции …………………………………………………………...236

9.4. Принцип фоновых признаков………………….………………….238

9.5. Метод селекционных индексов………………..………………….243

Контрольные вопросы и задания……………………………………249

 

Глава 10. Сравнение и выбор генотипов…………………………250

 

10.1. Особенности биометрических методов сравнительной оценки………………………………………………………………………250

10.2. Взаимодействие генотип-среда и проблема выбора …..…..251

10.3. Метод регрессии на средние …………………………….…….259

10.4. Сравнение сортообразцов с учетом стабильности признака.266

10.5. Совокупности сред (фонов) для сравнительного испытания

сортообразцов………………………………………………………..272

10.6. Сравнение сортообразцов по комплексу признаков……..…..278

Контрольные вопросы и задания…………………………………...282

 

Глава 11. Биометрическая генетика в селекции многолетних культур………………………………………………………………….…284

 

11.1. Особенности количественного анализа многолетних культур..284

11.2. Коэффициент повторяемости……………………………………..285

11.3. Количественная оценка взаимодействия подвоя и привоя……287

11.4. Оценка периодичности плодоношения многолетних растений…291

11.5. Многомерные статистические методы для подбора родительских пар………………………………………………………………………….294

Контрольные вопросы и задания………………………………………..299

 

Глава 12. Биометрический анализ качественных признаков …..300

12.1. Общие сведения……………………………………………………..300

12.2. Биометрический анализ изменчивости качественных признаков301

12.3. Оценка различий между наблюдаемыми и теоретическими долями………………………………………………………………………306

12.4. Дисперсионный анализ изменчивости по качественному признаку…………………………………………………………………....313

Контрольные вопросы и задания……………………………………….....315

 

Глава 13. Моделирование экологической и онтогенетической изменчивости признаков…………………………………………………..316

 

13.1. Биометрический анализ роста растений …………..……………..316

13.2. Влияние факторов среды и моделирование конкуренции растений..319

13.3. Эколого-генетические модели количественных признаков……..326

Контрольные вопросы и задания…………………………..………………..332

 

Глава 14. Компьютерный сервис селекционно-генетических исследований………………………………………………………………….333

 

14.1. Банки данных…………………………………………………………..333

14.2. Подсистема регистрации и документации экспериментального материала……………………………………………………………………...341

14.3. Прикладные программы анализа данных………………………….343

Контрольные вопросы и задания……………………………………………348

 

Приложения……………………………………………………………...349

Библиографический список литературы………………………………356

Предметный указатель………………………………………………….358

Указатель обозначений…………………………………………………369