ВАРІАНТ 15

1. Напрямки використання методів гібридизації нуклеїнових кислот. Створення і використання ДНК-мікрочіпів. Основні недоліки метода блот-гібридизації.

2. Методи визначення нуклеотидної послідовності ДНК. Метод секвенування ДНК за допомогою специфічного хімічного розщеплення ( метод Максама і Гілберта).

3. Секвенування ДНК методом полімеразного копіювання Сенджера (метод термінуючих аналогів нуклеотидів). Характеристика векторів для секвенування ДНК.

4. Гібридизація як метод виявлення специфічних послідовностей нуклеотидів. Гібридизація за Саузерном. Концепція STS-маркерів. Комп’ютерний аналіз нуклеотидних послідовностей. Електронна ПЛР. Підготовка матриць для полімеразного копіювання.

5. Переваги і недоліки вказаних методів секвенування ДНК. Альтернативні техніки секвенування (використання скануючої тунельної мікроскопії, секвенування за допомогою молекулярної гібридизації).

6. Стратегії секвенування всього генома окремих організмів. Секвенування кДНК. Етапи секвенування великих ділянок ДНК. Приклади секвенування ДНК окремих хромосом та геномів. Геноміка, транскриптоміка, протеоміка.

7. В експерименті з трансдукції у Escherichia coli фагом Р1 в якості донора використовували прототрофний штам, стійкий до азиду натрію (Aziг), а в якості реципієнта штам Leu- Thr- Azis (ауксотроф по лейцину та по треонину, чутливий до азиду). Оброблені фаголизатом реціпієнтні клітини висівали на селективні середовища для добору певних типів рекомбінантів: Leu+, Thr+ та Leu+ Thr+. У колоніях рекомбінантів, що виросли, аналізували неселективні маркери. Серед трансдуктантів Leu+ опинилося Azir - 48% та Thr+ - 2%. Серед Thr+ не було жодного клона Azir, a Leu+ - 3%. Жоден з рідких клонів Leu+ Thr+ не був Azir. Які середовища були використані для добору й аналізу трансдуктантів? Визначити розмір геному фага Р1.

8. Ген курячого овальбуміну містить 7 екзонних ділянок, приблизна довжина яких: 185-189, 45-53, 129-134, 116-119, 140-144, 152-158, 1030-1034 нуклеотидних пар. Скільки амінокислотних залишків входить до складу курячого овальбуміну?